L'aïmag portant le nom de la rivière Sélenge c'est donc cet hydronyme que nous étudions.
C'est au XVII° siècle, lors de l'exploration et cartographie de ces territoires qu'apparaît cet hydronyme sur les cartes russes.
Les écrits du VI°-VIII° siècle mentionnent la rivière sous le nom de Sélène. De-même, les écrits chinois retraçant l'Histoire des Ouïghours allant IX° au XII° siècle nous font découvrir un Solin. Le XVI° siècle russe - dont Godounov en 1667 et Spafarynous en 1675, permettront de lire les formes Sélenga et Sélimba. Citons aussi les sources mongoles dont l'Altan Kochi et l'Histoire Secrète des Mongols qui nous offriront la forme Selengge pour le premier et Selengke pour le second ; les deux auteurs signalant que l'origine du nom n'est pas resté dans les mémoires. Il existe plusieurs pétroglyphes classées Inscriptions de l’Orkhon. Elles présentent les inscriptions Selene et Selengge sans préciser s'il s'agit de l'hydronyme ou de fer.
Deux hypothèses ont été retenues pour expliquer cet hydronyme: l'une dérivant du Bouriate et l'autre de l'évenky.
La racine bouriate passerait par le mot Сэл = déversement, lac pour certains - mais ce mot à autres et multiples sens en bouriate ; le mot нуур - Nour = lac.
La racine évenk ferait lien avec le fer via le mot сэлэ - Sele = fer ; ceci probablement lié à la couleur de ses eaux sombres et chargées de limon argileux.
