Audierne est un des rares noms de commune dont la francisation soit totalement différente du toponyme breton qui est Gwiaen.
Si le toponyme breton Gwiaen est identique à celui de la rivière proche - le Goyen, le toponyme francisé en Audierne s'appliquait au bourg, et seulement au bourg. Gwiaen - Goyen dans sa forme locale, serait, selon certains toponymistes, un anthroponyme Uuoedgen formé de Uuoed - cri de guerre + Gen- naissance. Selon d'autres toponymistes, il faudrait rechercher une origine hydronymique à Gwiaen, dérivant alors de Gwazh - ruisseau ; signalons que Hodiern est aussi un anthroponyme porté au Bas-Moyen-Âge, dont, entre autre, par une abbesse de Locmaria de Quimper et, au XII° siècle, par une vicomtesse de Gourin.
Nous retrouvons présence de ce toponyme - avec néanmoins un doute, en l'an 1284 avec un Kaerhodiern qui s'écrirait sans doute Kerodierne actuellement. La présence d'autres formes toponymiques anciennes est aussi ttesté avec cet Odierna en 1313, ce Lettier Goezian en 1410 dans les Preuves de Dom Morice, ce Trefgoezien en 1498, ce Tregoazien autrement Kerangoezien en 1507 puis un Treffgoazien à présent dit Audierne pour le XVII°.
