C'est dans la première partie du XIV° siècle qu'est attestée la paroisse de Plougonvelin, en breton Plougonvelen ; nous découvrons ce toponyme avec un Ploeconvelen que nous revoyons quelques années plus tard, en 1369, avec un Plebs Comelen puis Plogonelen en 1390. Alors que le Ploegonvelen en Archreleon de 1432 nous précie que nous sommes en terres léonardes, nous noterons ce Guyconvelen de 1544 qui spécifie qu'il s'agit du bourg et pas de la paroisse toute entière qui serait Plou-.
Ce toponyme est formé de Plou- définissant la paroisse dans la totalité de son territoire et de saint Convelen, dont la vie, saint ou pentiern, nous est inconnue.